Отдел был создан в 2003 г., в результате реорганизации организационно-научного и редакционно-издательского отдела, функционировавшего в университете с 1994 г.

С 2007 г. отдел организации научных исследований и научной информации возглавлял кандидат философских наук полковник полиции Валентин Тильманович Жалкиев.

В 2015 г. отдел возглавил кандидат юридических наук подполковник полиции Сергей Александрович Федоренко.

В 2018 г. начальником отдела был назначен кандидат юридических наук майор полиции Сергей Сергеевич Киселев.

С 2019 г. отделом руководит кандидат юридических наук, доцент майор полиции Давид Борисович Данилов.

Отдел координирует научную деятельность филиалов, факультетов, кафедр и других структурных подразделений университета в области фундаментальных прикладных научных исследований по обеспечению основных направлений деятельности органов внутренних дел и учебного процесса в соответствии с профилем вуза.

Совместно с филиалами, факультетами и кафедрами университета отдел организует научно-практические конференции, круглые столы, семинары, совещания и иные научно-представительские мероприятия.

В 2009 г. отделом внедрена в практику рейтинговая оценка научной деятельности профессорско-преподавательского состава, позволяющая объективно определять количественные и качественные показатели вклада каждого преподавателя в научную деятельность университета.

C2008 г. создано и успешно функционирует научное общество курсантов и слушателей университета. Ежегодно члены научного общества становятся победителями, призёрами и лауреатами более 100 научных и научно-практических конференций, семинаров, конкурсов и олимпиад, победителями и призерами Всероссийского конкурса «Закон и правопорядок», конкурса на лучшую научно-исследовательскую работу обучающихся образовательных организаций МВД России, ежегодной студенческой юридической олимпиады Краснодарского края, Всероссийской научно-практической конференции курсантов, слушателей и студентов «Актуальные вопросы науки и практики» и многих других научно-представительских мероприятий.

Отделом налажено тесное взаимодействие с подразделениями центрального аппарата, территориальных органов и образовательными организациями МВД России.